Su trayectoria profesional ha estado vinculada al mundo de la alimentación y en concreto al control y la seguridad alimentaria. En los últimos años compagina su actividad en dicha área con la formación, como tutora en IMF Business School, (Máster de Calidad, Higiene y Seguridad Alimentaria, y el de Dietética, Nutrición y Seguridad Alimentaria), así como profesora en la Universidad.
Ha ocupado distintos puestos de responsabilidad en laboratorios de control de la calidad agroalimentaria, todos ellos acreditados por la norma UNE-EN ISO 17025, siendo en el último de ellos la Dirección Técnica y de Calidad de AENOR laboratorio.
Durante dichos años la vocación académica e investigadora ha supuesto la participación en varios proyectos de investigación, así como la publicación de varios artículos en revistas de diferente impacto.
Su actual dedicación a la docencia se inicia durante el doctorado en la Universidad de Navarra; posteriormente, en la Universidad Pública de Navarra como profesor asociado; su vocación docente continúo en sus distintos puestos de responsabilidad. Actualmente es profesora de universidad y tutora en IMF Business School.
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Agustina Sánchez es miembro del claustro docente de los siguientes programas: